DDZ - Nezverejnená dizertačná práca

Represia génovej expresie závislá od proteínov homologickej rekombinácie

Autor
Piteľová, Alexandra
Školiteľ
Bágeľová Poláková, Silvia
Oponent
Kolesár, PeterPolčic, PeterRačay, Peter
Škola
Univerzita Komenského v Bratislave PriF PriF.KBCh
Rok odovzdania
2023
Počet strán
130s.
Trvalý odkaz - CRZP
https://opac.crzp.sk/?fn=detailBiblioForm&sid=F806E6B7D49B8C8B146FFFF8458C
Primárny jazyk
slovenčina

Typ práce
Dizertačná práca

Študijný odbor
1420 | *chémia

Dátum zaslania práce do CRZP
25.05.2023

Dátum vytvorenia protokolu
25.05.2023

Dátum doručenia informácií o licenčnej zmluve
01.09.2023

Práca je zverejniteľná od
01.09.2025

Proteín Dbl2 zohráva v bunkách kvasinky Schizosaccharomyces pombe úlohu počas opravy DNA poškodení prostredníctvom homologickej rekombinácie, kde lokalizuje helikázu Fbh1, ktorá odstraňuje Rad51. Delécia génu dbl2 je sprevádzaná zmenou expresie viac ako 500 lokusov v genóme. Oblasti so zmenenou expresiou sú štatisticky bližšie k LTR oblastiam. Porovnanie transkripčných profilov dbl2 mutanta a mutantov v iných génoch zapojených do silencingu génovej expresie ukázalo významný prekryv oblastí so zmenenou expresiou medzi dbl2, hip1 a slm9 mutantmi (gény kódujúce podjednotky histón šaperónového komplexu HIRA) (Mišová, 2019). V tejto práci prinášame nové poznatky o expresnej analýze mutantov v ďalších génoch zapojených v dráhe homologickej rekombinácie (rad51Δ, mus81Δ) a spájania nehomologických koncov (pku70Δ a lig4Δ). Výsledky expresných a nukleozómových analýz ukázali zapojenie celej dráhy homologickej rekombinácie v procese represie génovej expresie a potvrdili jej spoluprácu s histón šaperónovým komplexom HIRA na udržiavaní normálnej štruktúry chromatínu v aktívne sa deliacich bunkách. Prostredníctvom mikroskopickej analýzy sme odhalili vplyv CENP-B homológa Cbp1 na lokalizáciu fókusov fluorescenčne značeného Dbl2-YFP, avšak tento jav pravdepodobne nesúvisí s úlohou Cbp1 v procese utlmovania génovej expresie v LTR oblastiach. Kľúčové slová: Schizosaccharomyces pombe, homologická rekombinácia, dbl2, HIRA, LTR
The Dbl2 protein is involved in DNA damage repair and homologous recombination in Schizosaccharomyces pombe cells, where it localizes the Fbh1 helicase that dismantles Rad51. The deletion of the dbl2 gene is accompanied by a change in the gene expression of more than 500 loci in the genome. Regions with changes in gene expression are statistically closer to LTR regions. Comparative analysis of dbl2 mutant and mutants in other genes involved in transcriptional silencing showed a significant overlap of regions with an altered expression between dbl2, hip1 and slm9 mutants (genes encoding subunits of the histone chaperone complex HIRA) (Mišová, 2019). In this work, we show data about the expression analysis of mutants in two other genes that are also involved in the homologous recombination pathway (rad51Δ, mus81Δ) and non-homologous end joining pathway (pku70Δ and lig4Δ). Gene expression analysis and nucleosome occupancy analysis showed the involvement of the entire homologous recombination pathway in the process of repression of gene expression and confirmed its cooperation with the histone chaperone complex HIRA in maintaining the standard structure of chromatin in actively dividing cells. Through microscopic analysis, we revealed the influence of the CENP-B homologue Cbp1 on the localization of fluorescently labelled Dbl2-YFP foci, but this phenotype is probably not connected to the role of Cbp1 in the process of suppression of gene expression near LTR regions. Key words: Schizosaccharomyces pombe, homologous recombination, dbl2, HIRA, LTR

Verzia systému: 6.2.61.5 z 31.03.2023 (od SVOP)