Fyziologickou súčasťou vývinu skorého embrya je riadená eliminácia poškodených alebo inak neprospešných buniek. Relatívne vysoká frekvencia výskytu buniek, u ktorých bol spustený mechanizmus samozničenia (apoptózy), bola popísaná v populáciách oboch embryonálnych línií: v embryoblaste i v trofoblaste. Cieľom dizertačnej práce bolo preskúmať schopnosť apoptotických embryonálnych buniek vysielať signál pre fagocyty, a súčasne kvantifikovať schopnosť normálnych susedných embryonálnych buniek vykonávať funkciu neprofesionálnych fagocytov. Mikroskopická analýza čerstvo izolovaných myšacích blastocýst ukázala, že externalizácia fosfatidylserínu je 10-krát menej častá ako priemerná incidencia apoptotických buniek (vyšetrená TUNEL značením). Napriek nízkej frekvencii signálu pre fagocytózu (v embryoblaste nebolo zaznamenané žiadne pozitívne farbenie fosfatidylserínu anexínom V), fluorescenčné farbenie plazmatických membrán ukázalo, že viac ako 20% apoptotických buniek bolo pohltených susednými blastomérami. Priemerná frekvencia apoptotických buniek, ktoré unikli pred fagocytózou a boli vylúčené do dutín blastocysty nepresiahla 10%. V rámci štúdia molekulárnych mechanizmov fagocytózy v skorom embryu sme sa zamerali na imunochemickú analýzu RAC1, enzýmu dôležitého pre preusporiadanie aktínového cytoskeletu. Proteín RAC1 bol pozorovaný v membránach niekoľkých štruktúr podobných fagozómom, ktoré obsahovali jadro s kondenzovanou morfológiou, čo je jeden z typických znakov apoptózy. Výsledky modelového in vitro experimentu, v ktorom sme myšacie blastocysty vystavili pôsobeniu apoptických induktorov (aktinomycín D a fipronil) ukázali, že skoré embryá sú schopné aktívne reagovať na zvýšený výskyt apoptózy zvýšeným klírensom apoptotických buniek susednými embryonálnymi bunkami. Záverom možno povedať, že embryonálne bunky majú všetky potrebné mechanizmy na rozpoznávanie, pohlcovanie a trávenie apoptotických buniek, a zabezpečujú klírens väčšiny umierajúcich blastomér. Fagocytóza pomáha preimplantačnému embryu zachovávať homeostázu dokonca aj za nefyziologických podmienok.