Mgr. Ivana Mišová: The Fission Yeast Dbl2 Protein and Its Novel Role in Gene Expression Regulation Comenius University in Bratislava, Faculty of Natural Sciences, Department of Biochemistry Dissertation thesis, 132 pages, 2019 Homologous recombination is a fundamental pathway of double-strand break repair. Our previous work showed that a newly characterized fission yeast protein called Dbl2 is required for homologous recombination and proper chromosome segregation during both mitosis and meiosis. The role of Dbl2 in these processes is in recruitment of the Fbh1 helicase, which disrupts a key intermediate of homologous recombination – Rad51-nucleofilaments. Here we present a role of Dbl2 in gene expression regulation in S. pombe. RNA-seq analysis of dbl2Δ transcriptome showed that deletion of dbl2 results in upregulation of more than 500 genes located near long terminal and long tandem repeats, including antisense transcripts, retrotransposons, meiotic genes and genes located in subtelomeric loci. Comparison of the expression profiles revealed that Dbl2 represses the same type of genes as the HIRA histone chaperone complex. Based on the localisation, genetic and physical interactions of Dbl2 and HIRA we propose that Dbl2 functions together with HIRA to repress detrimental transcription. However, unlike HIRA, Dbl2 does not influence centromeric or telomeric heterochromatin. Finally, we show that not only Dbl2, but also multiple other proteins involved in homologous recombination, such as Fbh1, Rad51, Mus81 and Rad54 participate in gene repression. Hence we propose a novel role for homologous recombination in gene expression regulation. key words: homologous recombination, gene expression, Dbl2, HIRA

Mgr. Ivana Mišová: Proteín Dbl2 v kvasinkách Schizosaccharomyces pombe a jeho nová úloha v regulácii expresie génov Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Katedra biochémie Dizertačná práca, 132 strán, 2019 Homologická rekombinácia je kľúčová dráha opravy dvojvláknových zlomov na DNA. V našej predchádzajúcej práci sme ukázali, že novopopísaný proteín Dbl2 v kvasinkách Schizosaccharomyces pombe je potrebný v procese homologickej rekombinácie pre správnu segregáciu chromozómov počas mitózy a meiózy. Úloha Dbl2 v týchto procesoch spočíva v pritiahnutí helikázy Fbh1, ktorá rozrušuje kľúčový medziprodukt homologickej rekombinácie – Rad51 nukleofilamenty. V tejto práci predstavujeme novú úlohu Dbl2 v regulácii expresie génov v S. pombe. RNA-seq analýza transkriptómu dbl2Δ mutanta ukázala, že delécia dbl2 vedie k zvýšenej expresii viac než 500 génov v blízkosti dlhých terminálnych a tandemových opakovaní, vrátane antisense transkriptov, retrotranspozónov, meiotických génov a génov v subtelomerických oblastiach. Porovnanie expresných profilov ukázalo, že Dbl2 reprimuje rovnaké typy génov ako histón šaperónový komplex HIRA. Na základe lokalizácie, genetických a fyzických interakcií Dbl2 a HIRA predpokladáme, že Dbl2 spolupracuje s HIRA na potláčaní škodlivej transkripcie. Narozdiel od HIRA však Dbl2 nemá vplyv na centromerický či telomerický heterochromatín. Kľúčovým pozorovaním v práci je zapojenie nielen Dbl2, ale aj ďalších proteínov z dráhy homologickej rekombinácie, ako Fbh1, Rad51, Mus81 a Rad54 v represii génov. Na základe týchto dát predstavujeme novú úlohu homologickej rekombinácie v regulácii génovej expresie. kľúčové slová: homologická rekombinácia, expresia génov, Dbl2, HIRA