Táto bakalárska práca sa zaoberá problematikou číslicového spracovania obrazu so zameraním na počítanie objektov v čiernobielych statických obrazoch. Ďalej sa venuje spôsobom tvorby obrazu pomocou detekcie katódoluminiscenčného žiarenia v rastrovacom elektrónovom mikroskope. Cieľom práce je oboznámiť sa s vyššie vymenovanými konceptami, naštudovať si kód open-source programu ImageJ (napísaný v programovacom jazyku Java) a následne v ňom vytvoriť plugin, ktorý vyznačí polohu defektov z panchromatických katódoluminiscenčných máp GaN vrstiev, čím nám umožní stanoviť ich hustoty na týchto mapách.